HRP2
Selon l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS), le paludisme demeure un problème de santé publique majeur, avec environ 241 millions de cas et 627 000 décès enregistrés en 2020. Dans les pays endémiques, il est crucial de tester chaque cas suspect et de traiter chaque cas confirmé avec un médicament antipaludique de qualité pour prévenir les décès. Les outils de diagnostic actuels incluent la microscopie et les tests de diagnostic rapide (TDR). Les TDR offrent des avantages notables par rapport à la microscopie, notamment leur rapidité, simplicité et facilité d'utilisation, et sont devenus essentiels dans les zones endémiques. Environ 90 % des TDR disponibles ciblent la protéine 2 riche en histidine de Plasmodium falciparum (PfHRP2), certains détectant également la PfHRP3 par réactivité croisée.
Cependant, des souches de Plasmodium avec des délétions des gènes Pfhrp2/3, qui échappent à la détection par les TDR basés sur PfHRP2, ont été signalées au Pérou, au Mali et dans d'autres pays africains. Cette situation pourrait compromettre la gestion des cas de paludisme et menacer l'efficacité des TDR actuels. L'OMS recommande aux pays touchés par ces délétions et à leurs voisins de surveiller ces délétions, surtout chez les patients symptomatiques, et de passer à des TDR autres que ceux basés sur PfHRP2 si la prévalence des parasites portant la délétion atteint 5 %. Depuis la première détection, des délétions Pfhrp2/3 au Mali en 2012 chez des personnes asymptomatiques, aucune étude systématique sur leur impact chez les patients symptomatiques n'a été réalisée.
La méthode traditionnelle pour les essais moléculaires consiste à utiliser du sang capillaire séché sur du papier filtre appelés taches de sang séché (DBS). Cependant, plusieurs études ont montré que l'ADN de Plasmodium extrait des TDR usagés est de qualité et quantité comparables à celui des DBS, et est approprié pour les analyses moléculaires même après un stockage prolongé à température ambiante. L'utilisation de TDR usagés présente des avantages notables, notamment une simplification du prélèvement, du séchage, du stockage et de l'expédition des échantillons, avec un risque de contamination croisée minimal.
Dans ce contexte, nous proposons de cartographier la distribution des délétions Pfhrp2 pour guider les décisions sur les tests diagnostiques optimaux pour le paludisme. Cette étude identifiera les zones nécessitant des ajustements diagnostiques et celles nécessitant une surveillance future.
Ce projet est dirigé par le Professeur Abdoulaye Djimde de l'Université des Sciences Techniques et Technologiques de Bamako (USTTB), en collaboration avec le responsable de la surveillance épidémiologique du Programme National de Lutte contre le Paludisme (PNLP) au Mali.
Ce partenaire a été choisi en raison de son expertise en recherche génomique sur le paludisme et de ses équipements de laboratoire. Les résultats seront communiqués au PNLP pour éclairer le choix des TDR locaux et à l'OMS.
Objectifs spécifiques :
1. Mesurer la prévalence des délétions suspectées des gènes pfhrp2/pfhrp3 chez les patients symptomatiques infectés par P. falciparum.
2. Évaluer la fréquence des délétions génétiques pfhrp2/3.
3. Identifier les districts où la prévalence des délétions génétiques pfhrp2/3 atteint ou dépasse 5%.
Méthodologie :
Ce projet déterminera la prévalence des délétions hrp2/3 dans les parasites de Plasmodium falciparum au Mali et évaluera l'efficacité des TDR actuellement utilisés dans le pays, ce qui profitera aux patients atteints de paludisme au Mali.
Contexte :
Le paludisme reste un problème de santé publique. Les pays où le paludisme est endémique devraient veiller à ce que chaque cas suspect de paludisme soit testé, que chaque cas confirmé soit traité avec un médicament antipaludique de qualité garantie afin de prévenir les décès.
Pour assurer cette surveillance de la délétion de PfHRP2/3, nous avons formé les techniciens de laboratoire dans 12 districts sanitaires sélectionnés et le district de Bamako dans la collecte simplifiée des échantillons, le séchage, le stockage et l’expédition à température ambiante de ces échantillons (bandelette de TDR, confetti). Les 12 districts sanitaires et le district de Bamako représentent les quatre strates de transmission épidémiologique du paludisme dans le pays. Ils ont été choisis à la suite de discussions approfondies avec le PNLP et en s’appuyant sur leur expérience dans des domaines tels que l’accessibilité, la disponibilité d’installations appropriées, la situation en matière de sécurité.
Déroulement :
Du 03 au 8 juillet 2023 la formation a été organisée dans la salle de réunion de PDNA à Sotuba, près de Bamako. L’objectif général était d’assurer la formation des techniciens de laboratoire de terrain dans le cadre de la surveillance épidémiologique de la délétion du PfHRP2/3 au Mali.
Au total, 06 techniciens de laboratoire par district sanitaire et 01 technicien par commune pour le District de Bamako ont participé à la formation.
Des cours théoriques suivis d’applications pratiques sur la collecte simplifiée des échantillons, le séchage, le stockage et l’expédition à température ambiante des échantillons (bandelette de TDR et confetti) et l’enregistrement des informations du patient à partir d’un questionnaire ont été réalisés. La formation a suscité un fort intérêt auprès des participants.
Une vidéo a été réalisée et mise à leur disposition pour engager un processus de formation continue.
Dans le cadre de ses activités de renforcement des capacités, le réseau PDNA a organisé une formation à l’attention des techniciens/personnels de laboratoires des programmes Nationaux de Lutte Contre le Paludisme (PNLP) des pays membres du Réseau PDNA.
Déroulement et objectif :
Participants : Venus de 7 pays d’Afrique dont : ( la Côte d’Ivoire, le Cap Vert, le Gabon, le Ghana, la Gambie, le Kenya et le Nigeria).
Cette activité s’est déroulée du 4 au 9 Mars 2024 dans la salle de formation de PDNA à Sotuba, Bamako-Mali en présence du coordinateur de l’atelier, Docteur Teketé qui a fait une présentation du Réseau PDNA, de l’ensemble des projets et a donné également l’état d’avancement des recherches en cours.
L’objectif de cet atelier était de permettre aux participants à générer, analyser et utiliser des données génomiques pour soutenir les efforts de lutte et d'élimination du paludisme en Afrique.
L'atelier a permis aux participants de :
- faire la réaction des polymérisation en chaîne (PCR) ;
- de se familiariser avec les différents marqueurs moléculaires de résistance des différents antipaludiques ;
- et de détecter les espèces plasmodiales par l’outil moléculaire.
Ces (7) sept jours de formation ont été marqués par une série de présentations suivies de travaux pratiques dans les laboratoires.
Cette opération a suscité un fort intérêt chez les participants, constituant une action extrêmement attractive et de découverte.
L’atelier s’est clôturé avec des mots d’encouragements et de félicitations du Coordinateur de l’atelier à l’endroit des encadreurs et des participants.
Un diner a été offert aux participants.